Эдди Брок и Веном снова в эпицентре погони — теперь за ними охотятся не только люди, но и пришельцы. Полиция уверена, что Брок виновен в исчезновении детектива Маллигана, а военные США при поддержке секретной лаборатории Зоны 51 начинают операцию по его захвату. Командование миссией берут на себя жёсткий Рекс Стрикленд и хладнокровная Тедди Пейн, мечтающая изучить симбиота.
Тем временем с другой стороны вселенной приближается угроза пострашнее. Налл, древний прародитель симбиотов, отправляет ксенофагов на Землю, чтобы вернуть Венома. Внутри симбиота спрятан Кодекс — мощный артефакт, способный пробудить повелителя. Однако разрушить Венома нельзя — иначе исчезнет и шанс на освобождение. Эдди и его напарнику предстоит сделать невозможное: спастись, не давая захватить себя, и защитить Кодекс любой ценой.